凡例二十則
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典據，非事更張。
一、焦竑《國史經籍志》，多分子目，頗以饾饤為嫌。
今酌乎其中，惟經部之小學類，史部之地理、傳記、政書三類，子部之術數、藝術、譜錄、雜家四類，集部之詞曲類，流派至為繁夥，端緒易至茫如，謹約分小學為三子目，地理為九子目，傳記為五子目，政書為六子目，術數為七子目，藝術、譜錄各為四子目，雜家為五子目，詞曲為四子目，使條理秩然。
又經部之禮類，史部之诏令奏議類、目錄類，子部之天文算法類、小說家類，亦各約分子目，以便檢尋。
其餘瑣節，概為删并。
一、古來諸家著錄，往往循名失實，配隸乖宜；不但《崇文總目》以《樹萱錄》入之種植，為鄭樵所譏。
今并考校原書，詳為厘定。
如《筆陣圖》之屬，舊入小學類，今惟以論六書者入小學，其論八法者，不過筆劄之工，則改隸藝術；《羯鼓錄》之屬，舊入樂類，今惟以論律呂者入樂，其論管弦工尺者，不過世俗之音，亦改隸藝術；《左傳》類對賦之屬，舊入春秋類，今以其但取俪辭，無關經義，改隸類書；《孝經集靈》舊入孝經類，《穆天子傳》舊入起居注類，《山海經》《十洲記》舊入地理類，《漢武帝内傳》《飛燕外傳》舊入傳記類，今以其或涉荒誕，或涉鄙猥，均改隸小說；他如揚雄《太玄經》舊入儒家類，今改隸術數，俞琰《易外别傳》舊入易類，今改隸道家；又如《倪石陵書》名似子書，而實文集；陳埴《木鐘集》名似文集，而實語錄。
凡斯之流，不可殚述，并一一考核，務使不失其真。
一、諸書刊寫之本不一，謹擇其善本錄之。
增删之本亦不一，謹擇其足本錄之。
每書名之下，欽遵谕旨，各注某家藏本，以不沒所自。
按，《四庫總目》每書名之下注明某家藏本，《簡明目錄》已略去。
其坊刻之書，不可專題一家者，則注曰“通行本”。
至其編次先後，《漢書·藝文志》以高帝、文帝所撰雜置諸臣之中，殊為非體；《隋書·經籍志》以帝王各冠其本代，于義為允，今從其例。
其餘概以登第之年、生卒之歲，為之排比。
或據所往來倡和之人為次。
無可考者，則附本代之末。
釋道閨閣，亦各從時代，不複區分。
宦寺之作，雖不宜廁士大夫間，然《漢志》“小學家”，嘗收趙高之《爰曆》、史遊之《急就》，今從其例，亦間存一二。
外國之作，前史罕載，然既歸王化，即屬外臣，不必分疆絕界，故木增、鄭麟趾、徐敬德之屬，亦随時代編入焉
一、焦竑《國史經籍志》，多分子目，頗以饾饤為嫌。
今酌乎其中，惟經部之小學類，史部之地理、傳記、政書三類，子部之術數、藝術、譜錄、雜家四類，集部之詞曲類，流派至為繁夥，端緒易至茫如，謹約分小學為三子目，地理為九子目，傳記為五子目，政書為六子目，術數為七子目，藝術、譜錄各為四子目，雜家為五子目，詞曲為四子目，使條理秩然。
又經部之禮類，史部之诏令奏議類、目錄類，子部之天文算法類、小說家類，亦各約分子目，以便檢尋。
其餘瑣節，概為删并。
一、古來諸家著錄，往往循名失實，配隸乖宜；不但《崇文總目》以《樹萱錄》入之種植，為鄭樵所譏。
今并考校原書，詳為厘定。
如《筆陣圖》之屬，舊入小學類，今惟以論六書者入小學，其論八法者，不過筆劄之工，則改隸藝術；《羯鼓錄》之屬，舊入樂類，今惟以論律呂者入樂，其論管弦工尺者，不過世俗之音，亦改隸藝術；《左傳》類對賦之屬，舊入春秋類，今以其但取俪辭，無關經義，改隸類書；《孝經集靈》舊入孝經類，《穆天子傳》舊入起居注類，《山海經》《十洲記》舊入地理類，《漢武帝内傳》《飛燕外傳》舊入傳記類，今以其或涉荒誕，或涉鄙猥，均改隸小說；他如揚雄《太玄經》舊入儒家類，今改隸術數，俞琰《易外别傳》舊入易類，今改隸道家；又如《倪石陵書》名似子書，而實文集；陳埴《木鐘集》名似文集，而實語錄。
凡斯之流，不可殚述，并一一考核，務使不失其真。
一、諸書刊寫之本不一，謹擇其善本錄之。
增删之本亦不一，謹擇其足本錄之。
每書名之下，欽遵谕旨，各注某家藏本，以不沒所自。
按，《四庫總目》每書名之下注明某家藏本，《簡明目錄》已略去。
其坊刻之書，不可專題一家者，則注曰“通行本”。
至其編次先後，《漢書·藝文志》以高帝、文帝所撰雜置諸臣之中，殊為非體；《隋書·經籍志》以帝王各冠其本代，于義為允，今從其例。
其餘概以登第之年、生卒之歲，為之排比。
或據所往來倡和之人為次。
無可考者，則附本代之末。
釋道閨閣，亦各從時代，不複區分。
宦寺之作，雖不宜廁士大夫間，然《漢志》“小學家”，嘗收趙高之《爰曆》、史遊之《急就》，今從其例，亦間存一二。
外國之作，前史罕載，然既歸王化，即屬外臣，不必分疆絕界，故木增、鄭麟趾、徐敬德之屬，亦随時代編入焉
