命門說
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《難經》謂：腎有兩枚，非皆腎也，左為腎，屬水，右為命門，屬火。後人非之，謂兩腎皆屬水，命門在兩腎之中，當脊骨自上數下第十四椎陷中；若自下數上，則為第七椎，正與臍對。引《内經》：鬲肓之上，中有父母，（謂心也。）七節（即第七椎）之旁，中有小心為證。謂兩腎在七節之旁，兩腎中間，即七節之陷中也，小心即命門。
《醫貫》又以中字為解，以太極形容。謂一中分太極，中篆作φ，○，太極也；│分太極為○。者。│，象人之脊骨，○，象人之兩腎，兩腎○相合，仍為一太極○。其中空白處，象命門。又兩腎既分為兩儀，則左腎為陰水，右腎為陽水。陽水者，氣之液也，坎水也。坎以一陽陷于二陰，水氣潛行地中，為萬物受命根本。《月令》于仲秋雲：殺氣如盛，陽氣衰，水始涸。是水之涸，地之死也。于仲冬雲：水泉動。是月一陽生，是水之動，地之生也。陰水者，形也。
兌，澤也。一陰上徹于二陽之上，兌以有形之水，普施萬物，下降為資生之利澤，其說甚有理。然與《難經》所言，大緻亦自無殊。蓋皆言腎雖屬水，而水中有火耳。
所用補火之藥，總屬一樣，豈有分别此味則入右腎，彼味則入七節？憂其岐誤，緻煩辨正哉。至趙氏謂命火乃先天之元陽，腎水乃先天之元陰，為生命之根本，治病必須求本。故凡寒之不寒，（用寒藥以治熱，而熱不退。）是無水也。無水者，壯水之主（主水者腎。）以制陽光，當主六味丸。熱之不熱，是無火也。無火者，益火之原以消陰翳，當主八味丸。（并見虛損。）遵其說而用之敗證。效誠如神。若初起遽以此投之，則謬矣。何則？初病止傷其後天之血氣，未遽累及先天之水火，故但熱之則寒消，寒之則熱退，随手立應，何必他求。乃不去其邪，而遽補其正，有不遷延時日，坐失事機者哉？何今之為醫者，泥于《醫貫》之說，不論新病久病，非六味則八味，非補中（見氣）。則歸脾，（見血。）竟若曆古方書，皆可删卻，亦惑之甚矣。或問：氣即火也，血即水也，兒在胎中，氣血已具，是氣血亦先天所生；六味補水，八味補火，是水火亦後天所養。今謂氣血為後天，水火為先天，毋乃輕氣血而重水火乎？曰：氣血者，水火之大綱也。人身呼吸運動，知覺神明，皆此火之為之也。氣可以言呼吸運動，不可以言知覺神明，是氣雖即火，而不足以盡火。人身之血液精髓，皆此水之為之也。血特水中之赤者耳，不可以概其餘，故血雖即水，而不足以盡水。有生之初，胎孕始結，形如露珠，父母之精氣也。是水火乃先天之先天，數月形成，而後血氣具，是血氣為先天之後天。若夫既生之後，飲食所長養之氣血，其為後天，又不待言矣。此水火、氣血，先後天之分如此。先天實為後天之根，故水火為氣血之原，而下焦又為中上之根，故腎命為水火之本。其輕重之分，固不能以無别也。（先天水火，又互相為根，如噓氣成水，陰根于陽也；蒸水成氣，陽根于陰也。）
《醫貫》又以中字為解，以太極形容。謂一中分太極，中篆作φ，○，太極也；│分太極為○。者。│，象人之脊骨，○，象人之兩腎，兩腎○相合，仍為一太極○。其中空白處，象命門。又兩腎既分為兩儀，則左腎為陰水，右腎為陽水。陽水者，氣之液也，坎水也。坎以一陽陷于二陰，水氣潛行地中，為萬物受命根本。《月令》于仲秋雲：殺氣如盛，陽氣衰，水始涸。是水之涸，地之死也。于仲冬雲：水泉動。是月一陽生，是水之動，地之生也。陰水者，形也。
兌，澤也。一陰上徹于二陽之上，兌以有形之水，普施萬物，下降為資生之利澤，其說甚有理。然與《難經》所言，大緻亦自無殊。蓋皆言腎雖屬水，而水中有火耳。
所用補火之藥，總屬一樣，豈有分别此味則入右腎，彼味則入七節？憂其岐誤，緻煩辨正哉。至趙氏謂命火乃先天之元陽，腎水乃先天之元陰，為生命之根本，治病必須求本。故凡寒之不寒，（用寒藥以治熱，而熱不退。）是無水也。無水者，壯水之主（主水者腎。）以制陽光，當主六味丸。熱之不熱，是無火也。無火者，益火之原以消陰翳，當主八味丸。（并見虛損。）遵其說而用之敗證。效誠如神。若初起遽以此投之，則謬矣。何則？初病止傷其後天之血氣，未遽累及先天之水火，故但熱之則寒消，寒之則熱退，随手立應，何必他求。乃不去其邪，而遽補其正，有不遷延時日，坐失事機者哉？何今之為醫者，泥于《醫貫》之說，不論新病久病，非六味則八味，非補中（見氣）。則歸脾，（見血。）竟若曆古方書，皆可删卻，亦惑之甚矣。或問：氣即火也，血即水也，兒在胎中，氣血已具，是氣血亦先天所生；六味補水，八味補火，是水火亦後天所養。今謂氣血為後天，水火為先天，毋乃輕氣血而重水火乎？曰：氣血者，水火之大綱也。人身呼吸運動，知覺神明，皆此火之為之也。氣可以言呼吸運動，不可以言知覺神明，是氣雖即火，而不足以盡火。人身之血液精髓，皆此水之為之也。血特水中之赤者耳，不可以概其餘，故血雖即水，而不足以盡水。有生之初，胎孕始結，形如露珠，父母之精氣也。是水火乃先天之先天，數月形成，而後血氣具，是血氣為先天之後天。若夫既生之後，飲食所長養之氣血，其為後天，又不待言矣。此水火、氣血，先後天之分如此。先天實為後天之根，故水火為氣血之原，而下焦又為中上之根，故腎命為水火之本。其輕重之分，固不能以無别也。（先天水火，又互相為根，如噓氣成水，陰根于陽也；蒸水成氣，陽根于陰也。）